1934年10月，红一方面军从于都出发，开始长征。之后，在强渡湘江、突破乌江、四渡赤水和飞夺泸定桥等重要战役中，都显示了朱德卓越的军事指挥能力。1935年3月4日，中革军委决定成立红军前敌司令部，任命朱德为司令员，毛泽东为政治委员，重新确立了“朱毛”对于红军的指挥。

红一、红四方面军于懋功会师后，由于红军分为左右两路军，朱德与张国焘共同指挥左路军。这支部队主力为红四方面军的部队，因此当张国焘试图另立中央南下时，朱德遭到架空，被调离了指挥部。但即便是在逆境中，朱德仍然有效地做了很多工作：他利用自己在红军中的崇高声望，和徐向前、罗炳辉等共同推动红四方面军将士接受北进的方针，在促成此事上起到了重要作用。鲜为人知的是，在左路军中，来自红一方面军的部分指战员曾有武力对抗张国焘、甚至捉拿他的计划，朱德并没有支持。他坚决反对红军打红军，坚持用和平的方式解决内部问题。

1935年7月，红二、六军团（后改编为红二方面军）在甘孜和红四方面军会师，朱德与贺龙见面。此后，在各方面的敦促努力下，红二、四方面军分三路北进，终于在1936年10月与红一方面军在会宁和将台堡会师。“朱毛”也在这时重新会面。

朱德元帅在长征过程中曾屡次遇险。特别是遵义会议后的土城之战，他亲自到前线指挥，一发川军打来的炮弹曾落在离他近在咫尺的地方，幸而没有爆炸。反而是国民党空军曾宣称在轰炸中炸伤朱德，倒属于子虚乌有的事情。

彭德怀在长征开始时担任红三军团军团长，率部于1934年10月10日从长汀出发，他所走的长征路，也正是红一方面军最标准的长征路线。他到达陕北的时间是1935年10月。

在红一方面军的长征途中，红三军团始终是最为重要的野战兵团之一。彭德怀指挥该军团连续突破四道封锁线，随后又恶战湘江，掩护中央机关完成转移。此后的娄山关、遵义、四渡赤水、巧渡金沙江等战斗中，红三军团皆有突出表现，与红一军团共同形成红一方面军的两个“拳头”。红三军团作战勇猛，损失也极为严重，军团参谋长邓萍、红四师师长洪超等皆牺牲在长征路上。当张国焘试图分裂红军时，彭德怀果断率红三军团随中央北上，1935年10月到达吴起镇，与陕北红军会师。此时，彭德怀的职务是红一方面军改编的“工农红军陕甘支队”司令员。

在吴起镇，彭德怀元帅指挥红军果断地消灭了尾追的敌军，毛泽东为此赋诗相赠：“山高路远坑深，大军纵横驰奔，谁敢横刀立马，唯我彭大将军。”彭德怀得诗后，将最后一句改为“唯我英勇红军”赠还。