第二步是对全国18家铁路局和3家专业运输公司（中铁集装箱运输有限责任公司、中铁特货运输有限责任公司、中铁快运股份有限公司）的公司制改革，即对运输主业的改革。

最后一步是改革最难的部分，即对中铁总公司的公司制改革。据多位信源透露，对中铁总公司的改革原则是实现绝对的政企分开，目前方案正在国务院和财政部审核，待上述部门作出批复意见后方可实施推进。

在近期中铁总举行的推进铁路公司制改革会议上，中铁总总经理陆东福表示，铁路企业公司制改革今年是起步和探索阶段，2018年要全面深化开展，目的是建立收、支、利刚性约束的预算目标管理制度。他强调，改革必须强化预算执行过程分析、控制和考核，发挥预算的激励约束作用，从而实现收入和支出按计划推进、实践和监控，从根本上消除经营和廉政风险。

当前铁路公司化改革明显加快，已有具体时间计划，表明改革进入强力推进阶段。据财新记者了解，发生如此重大转变的原因是，中央对近两年铁路改革进展缓慢提出了意见，认为中铁总在推进中央深化铁路改革等决策部署上不够有力，要求铁路系统立刻深化改革，加快政企分开步伐，完善企业化、市场化运行机制。（详见财新网报道，“中央巡视组：铁路改革部署不力仍存违规招投标”）其次，当前铁路货运形势大好，亏损减小，为改革提供了良机。（详见财新网报道，“前八月铁路货运高速增长中欧班列密度翻倍递增”）

目前全国共有18家铁路局，其中仅有广州铁路（集团）公司和青藏铁路公司以“公司”定名，其余16家还在沿用“铁路局”名称。一位知情人士表示，整合铁路局是大势所趋，但近期在改制上不会有太大、太快的动作。

北京交通大学经济管理学院教授赵坚认为，突破阻碍铁路深化改革的关键问题是铁路网是否能够拆分，这个问题不解决，铁路改革重组就难以推进。赵坚的思路是将现有的18个铁路局（公司）重组为北、中、南三大区域铁路公司，三大区域铁路公司之间的比较竞争，区域公司内相邻子公司间的平行线竞争，即两层面竞争的铁路运输企业组织结构。三大公司负责各自管内的调度指挥，具有投资决策财产处置的权利，成为真正的市场主体。

《中国铁路总公司2017年上半年审计报告》显示，中铁总2017年上半年亏损29.68亿元，创其成立以来最好业绩，较去年同期净亏损72.95亿元大幅减少59.31%。今年上半年，中铁总收入4699.43亿元，较去年同期4163.50亿元增长12.87%。

2017年上半年，中铁总运输收入合计3378.23亿元，同比大增19.82%。其中货运收入1293.01亿元，同比大增27.93%；客运收入1537.02亿元，同比增加13.59%。如算上建设基金，货运总收入已达1537.22亿元，与客运收入平分天下。

截至2017年6月30日，中铁总负债达4.77万亿元，较2016年同期4.21万亿元增长13.30%。负债率较去年同期微增至64.89%。