解放后，社会学被认为是伪科学，此后朱穆雍被分配至财政局工作。有这样一个文科背景的父亲，朱清时也建立了对文科的兴趣基础。

多年来，朱清时主要在化学圈里打转，对传统文化领域建树有限，但儿时对传统文化的痴迷一直让朱清时魂牵梦萦。

到了2004年，朱清时与一个人从相识到相知，这个人对其此后13年的学术兴趣转向意义非凡。此人就是南怀瑾。

朱清时后来说，南怀瑾“对古今的了解可以说没有人可比，没有人可及，他的智慧从我们这一代人来看，只能仰视。”

南怀瑾和朱清时，一个搞传统文化研究的，尊重科学但没有受过严格的科学训练；一个搞自然科学研究的，尊重传统但也没有接受过系统的中国文史哲教育。

大师与大师之间，碰撞出了异样的火花。

自从与南怀瑾相遇，朱清时就想通过其自然科学的逻辑和办法打通科技和佛学，为物理插上佛学的翅膀，为佛学研究用上实验室里的量杯。

朱院士还曾在另一场演讲中，幽默地表示：“科学家千辛万苦爬到山顶时，佛学大师已经在此等候多时了！”

朱清时在讲座中介绍自己的“实验”感受

不过，虽然朱清时可以用自然科学一本正经地讲佛学，但被他称赞的大师南怀瑾却不能用佛学的概念讲述深奥的量子论。

朱清时不遗余力地向外界“推销”南怀瑾，称南怀瑾学问如何博大精深。

他曾向媒体举例称，《楞严经》有一句“觉海性澄圆，圆澄觉元妙”。关于“元妙”的解释，南怀瑾曾告诉朱清时，“当时（唐代）为了避讳唐玄宗名字中的‘玄’，而将‘玄妙’的‘玄’字改成‘元’代替，一说玄妙，大家都知道了。”

若南怀瑾果真如此解释，那么正好说明南怀瑾对古代文字避讳所知甚少。中国古代是不避讳皇帝庙号的。同样因为传统文史知识匮乏，所以哪怕南怀瑾讲的是错误知识，朱清时也毫无察觉。

带着对传统文化的崇拜，大半辈子在物理学领域里摸爬滚打的朱清时，一头扎进了佛学、中医乃至“真气”研究里，甚至还用自然科学术语解释佛学知识，用以证明几千年前的佛教典籍都是符合自然科学的。朱清时很快成了佛教研究的明星人物。