绝大多数专家首先肯定了推广、研究基础物理的意义，也肯定了粒子物理对于人类认识世界的意义，但就大型对撞机项目落户中国却持有不同的看法，反对者对于大型对撞机项目的质疑点可以归结为以下四个方面。
1.科学目标不明确
“首先你需要拿出令人信服的科学根据，而不是打赌式的计划，因为谁也不能保证能够发现新粒子”。中科院院士李雷（化名）表示，LHC已经在此基础上做了很多年的实验，也取得了一定的成就，但却止步在一定的阶段。
正如今年八月在美国芝加哥举行的国际高能物理大会指出，大型强子对撞机LHC今年积累了25000TB的数据，然而却并没有发现任何新粒子证据，帮助产出大量论文的750GeV新粒子也正式宣告不存在，目标中的暗物质（LUX和PandaX）、磁单极子（MoEDAL）和惰性中微子（冰立方）也全部沦陷。一些年轻的物理学家们也开始质疑和反思，是否用于对撞机建造、研究的经费应该用在其它领域？
“那么在此基础上另起炉灶，用并无革命性技术、仅加大能级的装置的目的何在？能否找到新粒子还是一个未知数，在目标不确定的情况下投入巨大的财力物力，价值何在？大型科学装置本身就要对国家负责，关乎科研诚信的问题，有疑问的科学行为是否值得政府花费极大代价，答案本身就是否定的。”李雷院士表示。
2.关键技术不在手
在并没有革命性技术出现的背景下，许多科学家也在质疑中国大型对撞机项目是在用蛮力，且很多技术细节还需要依靠西方的支持。
这点不仅在国内受到诟病，西方也有人专门为此撰文。8月25日，《自然》杂志以“Who will build the next LHC?”为题，介绍了目前世界上主要的大型对撞机计划，包括正在运行的LHC以及日本计划建造的ILC（Japan-hosted International Linear Collider，大型直线对撞机）、CPEC、SPPC和升级版的LHC。文中显示，在2030年左右，规划中的升级版LHC和SPPC将会“撞车”，二者将会相互“影响”。
李雷院士也提到，他在与相关领域的技术人员探讨时获悉，很多关键技术仍掌握在西方手中，单靠中国现有的技术手段，很多技术细节无法完成，“在很多关键技术需要西方来完成的情况下，即便发现了新粒子，主要的贡献究竟是归功于出资占比大的中国还是掌握技术的西方，这本身也是个争议性的问题”。
3.重蹈SSC的覆辙
