2013年10月16日，原南京市委副书记、市长季建业因涉嫌违纪被查。次日，杨卫泽即在南京生态文明建设动员大会上发言，直指雨污分流工程是“表面文章，劳民伤财”。杨卫泽的上述表态在日后被一些媒体解读为是与“季建业做切割 ”。

进入2013年下半年，中纪委的反腐逐步深入，其时的杨卫泽还保持着他惯有的风度。一位江苏资深媒体人告诉长江商报记者，2013年冬天，杨卫泽在南京某宾馆出席一个会议，其穿着大衣最后到了会场，即在主位坐下，然后头仰后，肩膀微微一抖。身边的秘书立刻将滑落的大衣接了过去，“很威风，也很有派头。”

进入2014年后，关于杨卫泽可能落马的揣测，已经流传了大半年，坊间议论纷纷，南京青奥会是他的救命稻草云云--2014年8月16日在南京举办的青奥会是中国首次举办的青奥会，杨卫泽全力投入到青奥会的筹备当中，他提出了“大干一百天”的口号。

在苏州期间，杨卫泽在私下里曾有“老天帮我”这样的戏谑之语。“像搞一些重要活动，比如苏州每年一届的旅游节，开幕前几天一直在下雨，开幕当天雨就停了，然后开幕第二天又开始下雨了，所以杨卫泽有时候相信他的运气特别好。”苏州政界一位官员告诉长江商报。

在青奥会结束后的2014年9月13日，中央纪委公布：南京市委常委、建邺区委书记冯亚军涉嫌严重违纪违法被查。冯亚军成为南京青奥会后江苏省第一个落马的正厅级官员。

冯亚军是南通海门人，此前担任南京市河西新城开发建设指挥部常务副指挥长，是河西新城的主要执行者，而总体投资预算高达983.5亿元的河西新城，是杨任期内的头等大事。

5天后的9月18日，南京市警方发布消息称，该市原六合区区委书记娄学全在家中自缢身亡。

娄学全2011年12月曾任南京长江第二大桥管理局局长、南京长江第三大桥建设指挥部副指挥长、高级工程师；南京市交通运输局局长。娄死后，一首被认为是其遗作的诗在南京流传：

今日鸿门剑指谁？殷勤劝醉暗藏雷。江湖未有真情酒，为主酩酊却饮悲。满眼新荫难庇佑，一船旧友且相陪。桃源渡口人忽醒，由己之身弃秭归。

在娄学全死前一天晚间，杨卫泽通过《南京日报》的官方网站发表了题为“当官不易是当干部的应有之义”的文章，文中称“为官不易，当好官更不易”、“为官政声，最终由人民来评判”等，并落款这是发自他在井冈山干部学院学习的心得。

两名区委书记在一个月时间内，相继因涉嫌违纪违法被调查，南京官场反腐戏码逐渐被推向高潮。2014年12月26日，江苏省检察院发布消息称，已依法对南京市溧水区原区委书记姜明以涉嫌受贿罪立案侦查并采取强制措施。

姜明是南通市海安人，与冯亚军和娄学全一样，姜明也是2011年6月后担任所在区区委书记，彼时杨卫泽履新南京市委书记才3个月。

1月1日，杨卫泽身穿运动装，手持发令枪，以南京市委书记的身份参加了第33届元旦健身长跑活动。在长跑活动后，杨还登上明长城，学着伟人的口吻朗诵了毛泽东的诗词“雄关漫道真如铁，而今迈步从头越”。

这是他落马前的最后演出。

“你也可以理解为这是为了树立政绩，但制度设计的出发点是好的，胆子大，有魄力。阻力大是因为把相关部门的利益剥夺了，他把反对意见压了下来。”

--无锡市一位官员