陆委会的调子则明显不同。台湾《中国时报》称，陆委会提交的报告认为，在台方通报及再次完整说明立场后，整体上中国大陆反应低调克制，大陆媒体、学者及网民亦未有过度反应。陆委会还评估，此事件应不致对台海及区域情势稳定造成冲击。

事实上，整个质询就是一场矛盾百出的闹剧。据台湾东森新闻网报道，台海军参谋长梅家树面对蓝营“立委”逼问时，一度表示海军训练是以对岸为假想对象，立刻遭到“国防部副部长”李喜明“直接打脸”并打断其发言，李喜明表示，当天误射飞弹的中士只是随意设定一个坐标，没有针对任何特定目标的意思。梅家树一脸铁青站在一旁。

“民进党当局上台的种种做法才是‘荒腔走板’，一错再错，缺乏深刻反省，台湾这样下去会犯更大错误。”中国社科院台湾研究所研究员王建民5日接受《环球时报》记者采访时表示，台“国安局”添油加醋，以这种态度对待误射事件，可能会对两岸关系造成更大伤害。这件事上，蔡英文负有很大责任，怎么能放任“国安局”官员如此放肆讲话。这样重大事件不检讨，会对两岸造成什么后果？王建民说：“反问一下，假设这种事发生在大陆，台湾社会是不是要炸了？”台湾一些政客什么事都怪大陆，导弹误射还怪大陆，这反映了一些政客的病态心理，从来不知道自我检讨，还乱咬一通。“民进党这帮官员是如此不可救药，上台一个月就乱成一团了。”

台湾资深媒体人萧师言对《环球时报》记者说，绿营一向善于扭曲事实、寻找替罪羔羊的危机处理方式，只要社会上一发生任何对绿营不利的事件，他们马上就会找一个替罪羊，推卸责任。过去多年来，除了国民党，绿营所设定的另一个“最佳替罪羊”就是大陆，不断利用一些人“怕中”“仇中”的心理故意制造、转移矛盾，煽动对立。

“国际瞩目的台海安全漏洞”

“导弹误射事件，责任明显落在台湾，不但新政府的治军能力遭受国际质疑，新政府至今尚未建立两岸危机处理机制，也将成为国际瞩目的台海安全漏洞。”台湾前绿营“立委”郭正亮提到的这个问题也是岛内“侥幸没出大事”之后普遍后怕的一点。郭正亮5日在香港《南华早报》网站题为“台湾导弹误射的两岸冲击”的文章中写道，引发国际瞩目的雄风—3反舰飞弹误射事件，堪称是台湾近20年来最诡异的军事意外。事实上，台军误射事件并非第一次。1994年11月14日，小金门前埔40高炮阵地，试射61发火炮，结果误击厦门郊区，造成4名大陆居民受伤。这次导弹误射意外，如果不是因为射中渔船导致落海，导弹可能继续往西飞行，跨过台海中线，甚至还可能打到大陆船只，让原本就僵持难解的两岸关系，陷入更严峻的空前危机。文章认为，因为导弹误射事件，外界将进而要求蔡英文必须及早与大陆建立可靠的沟通管道。