1861年，英国人李泰国出任中国海关总税务司，在中国各大口岸建立对外来船舶的海关检疫制度。1863年，也就是黄宽回广州那年，中国海关医务处成立，在全国聘请医官。17人中仅黄宽一人是中国人，可见他在当时国内西医界的地位。

黄宽被聘为首批医务官后，在粤海关处工作。广州是中国重要的对外贸易港口，来往人员、船只繁多，医务官的责任相比其他港口更为重大。1875年，黄宽还曾担任过西南施医局主任。

1878年10月，黄宽患颈痈疽之际，英国驻华领事夫人难产，求他出诊，虽经家人再三劝阻，黄宽还是决意出诊救治。领事夫人平安，而黄宽归家后却颈痈疽突发，于12日去世，享年49岁。中西人士临吊者无不悼惜。

当年从广州赴美途中，“女猎手”号在圣赫勒拿岛补充粮食和食用水，容闳、黄胜、黄宽去凭吊拿破仑墓。他们在墓前的大柳树上各折一柳枝，在船上深加爱护。布朗体会弟子离别祖国的心意，将柳枝种植于他服务的纽约阿朋学校（Auburn Academy）校园，1854年容闳重游阿朋校园，柳枝已长成大树。而黄宽去世之前，柳树也已枯萎，可谓“树犹如此，人更何堪”。

黄宽的一生做出了不少开创性的事业，但一些研究者认为，他本可以取得更大的成就。或许是比较倔强内向的性格，令他不太善于与人做长期的合作，限制了他的进一步发展，此说仍待商榷。但“无论如何，黄宽作为一位被历史选择，被时代潮流推向前锋的人物，他的业绩是不会被历史遗忘的。”（记者卜松竹 部分文图资料据《首位留学美英的医生黄宽》《黄宽:中西文化交流的象征》《黄宽研究补正》）