1994-1998年拍摄1-3部 《刑事侦辑档案》饰高敏，1-2部《鉴证实录》饰聂宝意。1996年拍摄《900重案追凶》，是继小青之后看的第二个鲜明、迥异的角色。

陈美琪在事业发展高峰之际，拍完连续剧《抉择》之后便结婚。婚后陈美琪淡出演艺界，同时报读研修东亚大学的专业课程，1987年时获得工商管理硕士学位。

陈美琪至今有过两段婚姻，第一段婚姻是她的噩梦：1979年陈美琪与富商马清伟结婚，之后1986年与马清伟离婚，她通过很久时间才走出阴影。

陈美琪的第一段婚姻曾经轰动一时。她的前夫是香港富豪马清伟，1985年陈美琪怀孕后，因丈夫婚外绯闻多多，她不堪压力最后流产，两人最终以离婚收场。当时，坊间盛传“第三者”是女星关之琳，关、马两人常被拍下结伴出游甚至当街接吻的照片，关之琳还曾写过一封自白书，亲笔写下“我没有勾引马清伟”。

流产后，有段时间她每天都做噩梦，“梦见自己生出来的洋娃娃不是断胳膊就是断腿……”每次她都从这种噩梦中惊醒，流产阴影长达半年。“当时离婚，其实失望的不只是我，对方（前夫）也是很失望的，因为他想不到我会放弃。可我觉得他这个花心的性格到60岁都不会改变，我就想，如果我忍受到他60岁，那不是在浪费自己的生命么？我不要了。你去享受吧，我拿回自由。”

恢复单身的初期，陈美琪寄情于繁忙的工作，还跑回大学念书，拿了个工商管理学的硕士文凭，她用忙来慢慢消减离婚、早产的阴影。