第三步，扩增。使用聚合酶链式反应即PCR扩增将目标DNA片段进行复制，有时候甚至需要复制到几万倍。DNA是两条链，扩增就得把链打开，然后每条链和所需要的材料结合。打开时需要一种温度，结合时需要另一种温度，所以在这个过程中温度是需要不断变化的，经过高温变性、低温退火、引物延伸三步反应的多次循环，使DNA片段呈指数级增长。
第四步，检测。基因分析仪采用毛细管电泳技术进行DNA测序分析，得到STR（短串联重复序列）分型结果。
第五步，数据分析。分析单个样本是否达到检测标准，再计算两个样本间的亲权指数。
第六步，出具鉴定报告。一个流程下来，一般需要7-10个工作日。
三个以上位点不同
就排除亲子关系了！
亲子鉴定中，检测环节显然是最神秘的。
这个过程需要将DNA放入到一个完全封闭的仪器中，固定在一个位置，然后用电脑来操作机器。DNA会按照电脑发出的指令，从仪器这头“跑”到那头，DNA上的所有信号都会被机器收集下来。
同一对染色体同一位置上的一对基因称为等位基因，一般一个来自父亲，一个来自母亲。比如，样本A这个位点是16、16，如果是父子关系，那么样本B对应的位点中应该也有一个16。鉴定人会根据国家相关规范计算亲权指数（CPI）如果CPI值在一万以上，就能判断存在亲子关系。
那如果是基因突变呢？
“这已经包括了基因突变的可能性了。如果不同的位点在三个以内，不能排除基因突变造成CPI值小于一万，这种情况下还需要加做位点再次对比。”王旭芳说，如果21个位点中，有3个以上位点不同，基本上就可以排除亲子关系了。
一图了解
由图可知：左边两个是妈妈爸爸。四个孩子里面只有D1和S1是他们两个亲生的，因为子女不应该有父母没有的条带(除非发生罕见的基因突变)。D2则是妈妈和前夫生的，所以有两条红色的条带匹配不到图中的爸爸。S2则是领养的，所以一条都没有匹配到。
