当时，不堪忍受战乱的王化琴想回四川，陈云洁是山西人，不愿走，于是姐妹俩抱头大哭一场，含泪分别。王化琴怎么也没有想到，这一去，却给她人生涂上了一个抹不掉的污点。

第二天，一辆吉普车将王化琴送到机场，几分钟后，一架军用运输机从西安腾空而起，直飞重庆。

王化琴从此开始了军统生涯，她在军统局第一处从事日语密码研究，被授上尉军衔，化名王坎恳。按照军统局规定，两年不许通信，三年不准探亲。此后，她被派往自贡、成都邮电检查所任副所长、所长，负责检查中共秘密党员和进步人士的刊物、报纸、信件。在此期间，她与康乃尔重逢，由于并不知道康乃尔是秘密党员，仍同其往来密切。康乃尔还几次在王化琴的父亲王连山家里居住，在王连山的帮助下，康乃尔多次逃过追捕，转危为安。

王化琴智救康乃尔等人后，引起了军统局的怀疑，军统局组成了一个专案调查组，任调查组长的恰是当初介绍她加入军统的少将专员。由于害怕连累自己，加之王化琴出身大地主家庭，少将专员极力从中斡旋，为其说情开脱，并给军统局写了份报告，称无疑可查。王化琴仅受到关禁闭6个多月的处分。

康乃尔逃跑后，其弟康克明便和组织失去了联系，跑到昭化躲了起来，后来他到王连山家当管账先生，帮王家收租纳典。

1947年，毛人凤任军统局局长后，王化琴被调离局本部，回到广元，任邮电检查所所长。王化琴不愿再参与政治，于是辞职去了泸州，并认识了泸州中学校长陆长明，开始了新的人生。

从山重水复到柳暗花明

陆长明原籍河北中祥县，后举家迁往安徽，1927年参加革命后随即参加了共产党。在陆长明的举荐下，王化琴也来到泸州中学任教导主任，由于工作关系，俩人经常接融，时间一长即擦出爱情的火花，确定了恋爱关系。王连山为女儿举行了盛大的婚礼。

1948年秋，夫妻俩生了第一个女儿，不幸的是不几天便夭折了。1949年7月，又生下大儿子陆勇。

不久，陆长明辞去泸州中学校长职务，携妻儿回到广元，任昭化县立中学校长，王化琴则任主任导师兼中英文教员。解放后，王化琴参加了昭化县举办的教师座谈会，学习结束后，正式分配到昭化中学（今宝轮中学前身）任教。

此时的王化琴婚姻美满，儿女双全，事业有成，步入了人生最辉煌的时候。