虽然二十九军内部出现了亲日派，但是北平特务机关的分化工作，也只对少数将领起到了作用。于是他们对二十九军的主要将领实行了一系列暗杀活动。

萧振瀛是筹建二十九军的骨干，在冀察政务委员会成立后任经济委员会主任委员，不久被国民政府任命为天津市长。萧奉命负责对日交涉，坚持“不说硬话，不做软事”的原则，以地方政府说了不算为理由，与日军方周旋。1936年5月，天津发生学生运动，萧以市长身份和学生进行谈判。日军不能容忍他继续留在华北，而对宋哲元施加压力，逼其去职。萧去职后暂住北京香山寓所，当日本特务刺探到“萧氏下野后，还在左右着宋哲元的行动，还在决定着二十九军的军务”时，日军便指使石友三去搬弄是非，未果，决定采取暗杀行动。当冯治安从何应钦那儿得知日方暗杀萧的计划时，便火急命何基沣组成“香山卫队营”保护萧振瀛，萧得以幸免。

这位冯治安，是二十九军的骨干筹建者，任二十九军三十七师师长，曾在1933年喜峰口战役中积极抗战，七七事变时担任北平城防司令，在冀察政务委员会成立后任河北省主席。在七七事变前一天，冯治安在保定接到报告称日军在长辛店和卢沟桥附近举行军事演习，出动人员极多，并携有重武器。作为二十九军的代理军长(此时宋哲元在山东乐陵)，他感到情势危急，当即乘专列赶回北平。当时日军准备在长辛店附近炸毁冯治安的专列，因错过时间阴谋未得逞。

宋哲元是二十九军的军长、冀察政务委员会委员长，因宋在中原大战中反对蒋介石，而被日军方看中，认为宋能在其策划的“华北自治”中起到举足轻重的作用。日本希望能同宋签订《华北防共协定》，以脱离南京国民政府，被宋拒绝。后日本邀宋访日，宋又拒绝。为躲避日军纠缠，1937年5月，宋哲元回故乡山东乐陵，任命冯治安代理二十九军军长，指定秦德纯负责对日谈判。7月11日，宋哲元从山东回到天津，处理对日关系。宋一到天津，就被张允荣、陈觉生、齐燮元等包围，立感天津气氛不对，这时又接到李世军转达的蒋介石密电(电话暗语)，得悉有阴谋对自己下毒手的消息，遂提高警惕，不在外吃饭。7月18日，宋哲元会见香月清司，日方要求宋签订和约，宋对香月态度极为和缓，说要回北平与冯治安等商量，于19日上午七点半乘火车逃离天津。此时日军方已认定宋哲元不可能再被利用，其存在对他们吞并华北将是一个阻碍，决定对他采取行动，在杨村附近放置炸弹，企图炸死宋哲元。所幸宋哲元经过时，炸弹未爆炸，日军方的暗杀阴谋未得逞，宋于上午十点到达北平。

刘汝明也是老西北军将领，二十九军组建后，先任副军长，后任暂编第二师师长。因在罗文峪战役中立功，国民政府将暂编第二师正式编为一四三师，驻防察哈尔省，刘任师长兼察省主席。1937年7月25日，宋哲元给在北平的刘汝明打电话说:“子亮，你赶快回去，照计划做，八月一号行动。”但他们的通话已被日本特务机关侦知。刘汝明匆忙只带着母亲从平绥铁路往张家口赶，当“车过沙河站后约十分钟，日军即赶抵沙河，强行拆除路轨五百公尺”，企图阻止刘汝明回察省抗战。但因日军晚来一步，刘安全到达张家口。

另外，早年参加西北军，时任三十八师参谋长的张克侠，也遭到了“交通事故”和“不明身份浪人”的袭击。

日军特务机关除对二十九军和冀察政权进行分化、对二十九军主要将领进行暗杀外，还直接以宋哲元的名义、用假的图章、签名伪造二十九军的作战命令等活动，试图扰乱二十九军的指挥系统，在此就不一一赘述了。（李惠兰 薛凤 陈政祥）