阮晋勇和阮富仲可以说完美的代表了越南的南北两派，而近年来两派的斗争已经到了白热化的阶段。
在2012年的越共十一届六中全会上，越共高层以不点名的形式严厉批评了阮晋勇，甚至将其写到全会报告中：“历届政治局、书记处存有若干大缺点……这导致越南船舶工业集团等一些国家经济集团造成巨大损失，留下极为严重后果……政治局全部达成一致建议中央委员会对政治局采用一种纪律处分形式并审议对一名政治局委员予以纪律处分。”
由于阮晋勇分管经济，一直以来主张打造大型国企，而彼时刚被查处的越南船舶的董事长和阮晋勇私交甚密，所以这次不点名批评将矛头指向了阮晋勇。
而越南的党报《人民报》“帮助”越共完成点名，《人民报》当时发表了一篇评论称“如果总理做错事，一样要接受党的处分。”虽然后来《人民报》表示这是编辑失误，把“总经理”误写成了“总理”，但其中含义不言自明。在越共十一届六中全会闭幕后不到一个月，阮晋勇再遭打击，越南国会议员杨忠国认为阮晋勇需要为越南严重的官员贪腐和大量的银行坏账负责并辞职。
阮晋勇很快在次年5月进行了强势的反击，在越共中央政治局的增补选举中，两位党主席阮富仲支持的人选遭到了越共中央委员会的否决，取而代之的则是阮晋勇的亲信阮善仁和阮氏金银。而另一名越共中央政治局委员，现任越南副总理阮春福被认为最有可能接任总理一职，他也被视作是阮晋勇的亲信。由于越共政治局成员较少，阮晋勇的派系此时大量进入政治局为自己在越共十二大争权完成了关键性的布局。
2014年，越共内部的不和延伸到了外交领域。中国的981海上钻井平台在中国西沙海域作业时遭到越南大批船只的非法干扰，随后越南还发生了反华示威游行，大量中资企业在越南遭到打砸抢烧，多名中国公民的生命安全受到威胁。
这次反华暴乱发生后，越共中央将其定性为“反共反社会主义的，以民族主义为借口发生的暴力行为”。而阮晋勇则向越南数百万民众发送了内容为“总理请求和呼吁每一个越南人，发扬爱国主义精神，以合法的行动捍卫国家的神圣主权”的短信。”对于越共对事件的定性，有报道指出阮晋勇表示“我对这个有保留。”
阮晋勇在这件事上的举动可以说是煽动民粹加上“公开对抗中央”，这也解释了为何近年来越南在对华政策上出现种种前后矛盾的情况。2014年MH370失踪时，越南积极配合中国的搜索行动，甚至开放领空让中国的图154电子侦察机进入，这被视作是非常友好的举动。但不到两个月后越南又做出派武装船只干扰中国钻井平台作业这样极其危险的举动。越南日趋激烈的党内斗争使得其对华政策摇摆不定。
