广州市荔湾中心医院由荔湾区第一人民医院与荔湾区妇幼保健院合并而成。2001年至2019年，该医院由广州医科大学托管，并按照医科大学附属医院管理模式进行管理。2019年9月，医院回归荔湾区政府管理，2020年1月更名为“广州市荔湾中心医院”。同年5月，医院晋升为三级综合医院。6月，医院成功创建了荔湾区首个广东省胸痛中心。经过近二十年的三甲医院管理模式以及医科院校浓厚学术氛围的影响，广州市荔湾中心医院在学科建设方面取得了显著成就。