专家们普遍认为，江豚是鄱阳湖重要的“主人”，建设大型水利枢纽必须将它们的生存环境、洄游需求等因素考虑在内。

“我们承认在工程修建期间会对江豚洄游产生阻碍，但是闸门修建之后，洄游是没有问题的。我们特别为江豚设计了4孔的，每个孔口宽60米的大水闸，游过去是没有问题的。”鄱建办副主任纪伟涛这样回应：“武汉水生所养的江豚，在人为诱惑的情况下，能够通过最窄2米宽的窄门。60米绰绰有余。如果到时候洄游受阻，我们还可以通过考虑人工干预，捕捞江豚来进行种群定向交换。”

对于人工干预能否顺利进行，是否是长久之计，中国农业生态环保协会渔业分会副秘书长王亚民表示存疑，对于江豚能否找到并顺利穿过2800米大闸上的4个60米闸门，他也并不看好：“野外江豚和水生所的江豚不能相提并论，而且闸门一旦修好，会有内外的水位高差，江豚能否顶水往上游，或者顺水往下游都是一个未知数。”

王亚民担心，在目前国内对于江豚在自然水域的行为学研究还不是特别充分的情况下，匆忙修闸，可能会造成难以挽回的后果。

上海将面临饮用水危机？

鄱建办：建闸就是有水大家分

“鄱阳湖建闸会影响下游的用水安全，尤其是上海，一旦出现饮用水危机，后果不堪设想。”

清华大学水利系教授周建军表示担忧，他说，由于上海处于长江入海口，一旦枯水期长江来水不足，无法形成对海水的顶托，将会导致海水倒灌。而上海70%的饮用水取自长江，一旦出现这样的情况，上海千万人口将会陷入用水危机。

对于这样的担忧，鄱建办副主任纪伟涛表示完全没有必要：“鄱阳湖截留的是洪水的尾巴，并且在枯水期采取拦水不蓄水，入湖多少水，泄多少水的方式。我洪水期存下的水，到了枯水期下游省市一起用，是好事。”

靠建闸缓解生态是治标不治本？

鄱建办：其它问题一直在解决

“近些年我一直在关注鄱阳湖生态恶化的问题。通过（建闸）缓解枯水期来改善鄱阳湖生态，根本没有对症下药！”岳桦，中国绿发会濒危物种基金志愿者。鄱阳湖，他每年不知道要来来回回走几趟。

鄱阳湖水利枢纽工程被定义为生态工程，关键在于方案制定者认为，建闸可以解决造成鄱阳湖生态恶化的主因：枯水期加重。而大多数的环保人士认为，枯水期加重并不是造成鄱阳湖生态问题的主要原因，采砂和非法排污才是最重要的源头。