最终，宁泽涛在男子100米自由泳的半决赛上，游出了47秒96，这也是当时的世界第二好成绩，然而令人意外的是，第二天100米自由泳决赛前的半个小时，宁泽涛突然宣布退赛。“其实这几天到赛场以后就出现这种状况了，肠易激综合征，自己身体不自觉地出现干呕，有发恶心这种感觉，那天一天比赛下来之后，晚上吃完饭回到酒店有些不舒服，然后感觉身上有些疼，感觉可能要发烧，队医量过体温发现有些低烧，当时就接近38摄氏度了。”宁泽涛说，随后，各种传言接踵而至。“猜测只是猜测，但是，宁泽涛确确实实，半决赛以后就倒了，第二天他是发烧了。”叶瑾教练说，“第二天我去看他，他身上很烫，那不是装出来的，一个运动员生病，我还能强求他吗？”

宁泽涛自曝饭卡消磁被要求搬出回忆称人性丑陋

2016年6月份，宁泽涛第二次随队来到澳大利亚外训，宁泽涛表示，当时外训非常好，以当时的状态，“站在奥运会领奖台上是大概率的事情”。宁泽涛说，在澳大利亚的时候，一些不和谐的声音就已经传出，在外训快结束的时候，国家游泳中心突然通知他暂停国家队集训，返回海军队待命。

奥运会之前，宁泽涛代言的问题被曝出，甚至传出他不能参加里约奥运会的消息。“6月19日回国之后，各种事件层出不穷，先是饭卡消磁，然后被要求搬出公寓。”宁泽涛说，实际上在拍摄当天，他公寓内的炉灶已经被停掉，“并且主管教练不再出现在泳池，并且大规模出现所谓的爆料事件。之前因为有队友已经走了，所以借了别人的饭卡，公寓的管理员敲门，要求限我三天时间搬出去，我来的时候是有文件通知来的，我搬走也得有文件，我才能去向地方的领导报告，因为我们是有组织的。管理员说去要这个文件，但是最后不了了之了。”

作为短距离项目的突破点，宁泽涛却接到了“可能不能参加里约奥运会”的内部通告，原因是他擅自私自签约存在利益关系的代言，并在多次规劝时顶撞领导，并以停训和退役相要挟。“其实这个事情在年初就开始了，就是代言的问题，运动员可能有运动员自己的想法，国家有国家的想法，游泳中心领导也有自己的想法。”叶瑾教练说。

宁泽涛表示：“这里面的事情不是很简单，有太多太多复杂的事情在里面。如果要从头讲，那就要从喀山世锦赛开始讲。”从问题被曝出到7月18日最终确认可以参加奥运会，五个星期的时间里，宁泽涛表示：“说自己很好那都是些假话，是为了不让自己的家人和朋友来担心我，因为我很年轻的时候也经历过很多，经历过最信任的人的背叛或者嘲讽，自己也经历过很多人情世故，自己也看清了人性的丑陋，但是自己还是非常乐观的，只要别让我失去信心和信任。当时自己还是希望能站在奥运会上，为祖国争取荣誉，所以再难也要坚持下来。”