雷雨说，除了水门，在对北城墙的考古发掘中，还发现了一条“大沟”，这条大沟将月亮湾小城和北城墙隔开，而且马牧河穿三星堆古城而过，说明三星堆时期这里的水系很发达。

对于三星堆古城的水系问题，陕西省考古研究院院长王炜林认为，水门的发现很重要，因为水系与古代聚落有很紧密的联系。

江苏省考古研究所所长林留根也表示，水系问题至关重要，与城池的使用和功能布局有关，苏州的古城就存在城内的护城河沿着城墙走的情况，“而且我注意到，三星堆古城墙的拐角与正常的墙面拐角不一样，是否与水系有关值得探究。”记者了解到，早在2014年初，考古人员在对北城墙进行确认性试掘的同时，在其所在的真武宫台地与西泉坎台地之间的疑似古河道处进行了寻找北城墙壕沟的钻探工作，意外地在古河道中部地表4米以下发现了一处面积约80平方米的平铺木构遗迹，木构遗迹与“北城墙”间还有长条形坡状分布的疑似卵石道路，初步推测应为与三星堆古城同时的“码头遗迹”。雷雨说，如果这处疑似的“码头遗迹”能够被确定下来，再结合此地发达的水系，也许可以说明当时的三星堆也曾是“东方威尼斯”，就能证明三星堆古城水上交通的发达。李伯谦教授认为，三星堆古城的第一道防线应该是错综复杂的水系，然后才是古城墙，城墙还兼具防水和祭祀等功能。