中纪委官网曾刊文提出，“纪检组和党组之间的关系没有理顺。纪检组长作为党组成员当然有利于纪检组长参与集体决策，拥有投票权而不仅仅是列席会议，但是其是否要服从党组的决定是个矛盾”。该文章称，在原卫生部参加中纪委监察部派驻机构统一管理试点时，时任卫生部部长就提出一个问题，“纪检组组长是党组成员，是否要执行党组决定？”

今年3月中纪委第二次机构改革后，上述局面已有改观。各中央单位均强调纪委书记（纪检组长）的“专职性”、“独立性”，剥离了之前纪委书记的其他兼职。

证监会纪委监察局发文称，“过去，特别是派出机构的纪委书记多数是兼职，难以保证纪委书记把主要精力放在纪检监察工作上，证监会党委作出决定，把全系统单位的纪委书记均设为专职，不再兼任任何行政职务”。

纪委书记（纪检组长）“独立”后，各单位开始约谈“施压”。

如交通运输部，上月，该部党组成员分率7个约谈组，约谈了63个部属单位204名党政主要领导及纪检机构主要负责人。

值得关注的是商务部，明确了党组和纪检组如何沟通配合，制定了“党组和纪检组加强沟通协商的意见”，规定干部选任等七个方面，党组要与纪检组沟通协商。

一央企员工对新京报记者说，“纪委地位明显提高了，今年几次会议都强调纪委对同级党委的监督职责，原来可没有这么频繁”。

程文浩认为，上述举措，都是在解题，双重领导体制如何具体化、程序化、制度化？纪检组和党组之间的关系怎样协调？“这是今年的重点。三中全会确定了改革思路'落实党风廉政建设责任制，党委负主体责任，纪委负监督责任'。4月到5月，王岐山书记一个月内先后6次主持召开专题座谈会，强调落实党风廉政建设的主体责任和监督责任。”