“特别移送”档案中发现有朝鲜人。延吉宪兵队《关于处置“苏联间谍”李基洙的报告》记载，李基洙为朝鲜人，原籍为朝鲜咸镜南道新兴案郡东兴面。这是首次发现档案记载的被“特别移送”的朝鲜人。
3.涉及南京大屠杀档案提供了日军屠杀罪行新佐证。南京大屠杀是日本军国主义犯下的严重战争罪行之一。1937年侵华日军在南京及附近地区进行了长达6个星期的大屠杀，我30万同胞死于这场杀戮。这批档案涉及南京大屠杀的有6件，包括3件报告、2件《邮政检阅周报》、1份《大阪每日新闻》，记录了南京大屠杀后1至2个月内南京、上海及周边地区治安恢复状况和日军屠杀、强奸的暴行，与之前的国内外史料研究成果相互印证。
发现大屠杀前南京人口总数有100万的证据。南京大屠杀发生2个月后，日军华中派遣宪兵队《关于南京宪兵队辖区治安恢复状况调查报告（通牒）》中，清楚记录了日军在实施南京大屠杀前南京人口为100万。这份报告直接戳穿了日本右翼“屠杀前南京人口不足30万”的谎言。
当时的日本媒体报道了大屠杀惨况。1937年12月23日的《大阪每日新闻（奈良版）》刊登《南京总攻击观战记》的报道，记述了日军在3日内打死8.5万人，离下关码头最近的一条街到扬子江下游尸体绵延达二三里远的惨状。
第三方国家的新闻机构谴责了日军暴行。2份日军中国驻屯宪兵队《邮政检阅周报》记录了从英国和德国发往中国的信件，信中摘录了当地报纸报道的日军兽行：“日本兵在南京强奸妇女数万人，甚至连十二岁的少女也被强奸，强奸后被惨杀者不可计数，实在是惨无人道。”“日军在南京的禽兽行为令人发指，连尼姑在内，年满14岁的女子全部被他们的兽欲所害。”写信者的消息来源是第三方国家的新闻机构，具有较高的客观性和可信度。
4.发现日军奴役劳工新证据。从20世纪90年代开始，中国民间自发组织对日本侵华时期奴役劳工行径进行调查索赔追讨。但因日本右翼声称证据不足等原因，受害方一直没有得到合理的道歉和赔偿。这批档案涉及日军奴役劳工的有14件，包括12份报告、1份《通信检阅月报》、1份管理制度，记录了日军对以中国战俘为主的“特种工人”的严格管理、残酷迫害和劳工恶劣的生存状态，以及劳工逃跑、反抗的各种情况，具有较高的史证价值，也为被奴役劳工及其家属向日本政府索赔、维护权益提供了依据。
发现“特种工人”的提法。《关东军特种工人管理规定》规定了派遣军移交关东军的俘虏、投降兵在部队施工时需注意的管理事项，其中明确规定，“关东军把从驻华北日军移送过来的俘虏、投降兵用做军用劳工者称为特种工人”。
“特种工人”主要“就劳”军事工程。东宁宪兵队《特种工人状况报告》记载了东宁要塞接收“就劳”特种工人1900余人，这些人是在战争中被俘的包括八路军战士在内的中国军人。
“特种工人”受到残酷奴役和迫害。档案中记录这些“特种工人”由于生活状态恶劣，死亡、逃走事件频发。东宁接收的“特种工人”两个月间死亡163人，先后发生53人、8起逃走事件。14件档案中记载了近900名劳工反抗、逃走的信息。宪兵队对逃走劳工抓到后处罚极为严厉。昭和十六年（1941年）7月8日上午11点左右，丁五才等八九名“特种工人”密谋逃跑，被发现后以传染病患者为由将其逮捕调查，秘密处死。
5.涉及“违禁”内容的档案使日军暴行欲盖弥彰。此次发掘的档案中，涉及“违禁”内容的有23件，包括22件邮检月报、旬报，1件《军事警察要报》，其中15件是日本人之间的信件。特别是《邮政检阅月报》档案，来源于侵华日军从邮品中摘抄出来的“违禁”内容，出自日本军人之手，是侵华日军对于自己侵略行径的直接记录。
日军通过邮政检查制度封锁暴行真相。日军占领东北后，以“加强防谍”的名义制定了军事邮件检查及地方普通邮件检查制度，即对占领区中外籍人士，包括驻伪满洲国各国公使馆人员及所有在华日军和家属的信件、电报、电话进行秘密检查。一旦发现被认为泄露军事机密、对日军不利的言论，包括反映了日军烧杀抢掠行径的信件、电报等，便作出削除、没收、扣押、烧毁等处置，并由各地宪兵队对认为有问题的摘抄整理，形成《邮政检阅月报》，上报给关东宪兵队司令部，关东宪兵队司令部在此基础上向关东军司令官报告，并在关东宪兵队和派遣军宪兵队司令部间相互通报。重点汇报有抗日反满内容的信件，对时局不满、反映日军军纪松弛的信件，暴露日军编成装备、军队行动、军事演习等方面的信件等。
日官兵在信件中透露了自己的暴行。1938年3月12日，隶属于日军华中荻洲部队的渡边德右卫门在发给新潟县西颈城郡上早川村关原草苗的信中写道：“二月六日我中队在警备中，附近有近万名残余敌人。可怜的是当地老百姓，因为接到全部杀光的命令，虽然我们对小孩子多少抱有一丝同情，但含着眼泪，一起杀掉的也不少！”1938年6月8日，隶属于奉天工藤部队的木村镇雄在寄给石川县金泽市的妻子木村美代子的信中写道：“同事通过地理和语言判断强奸的对象清一色是满洲女人，然后不分日夜对其强奸。很多女人被数百名男子强奸……”在1940年牡丹江铁道局东宁特输的植田益夫发给京都中京区王生溯田町三六号古川次郎的一封书信中说：“已经干涸的小河河道里横七竖八地搁着十二三具劳工的死骸和装在箱子里的尸体，野狗啃食着他们，一点也不剩。”
日军严密监控和封锁士兵的厌战情绪。此次公布的涉及“违禁”内容的档案反映了一些日本军人厌战思乡的情绪。昭和十六年（1941年）日军华北派遣队长野部队藏重部队古泉正一写给新潟县中蒲原郡龟田町吉田常松的信件中，记录了自己用刺刀杀中国人像切豆腐一样的情景，也有自己杀人时害怕、恐慌的心理描写。此信件被“削除”处置，使得家属了解不到士兵的真实心理。
6.涉及“开拓团”的档案证明了日本移民侵略实质。这批档案涉及日本“开拓团”的有10件，包括6件思想对策月报、半年报，1份通牒，1份民情调查，1份“开拓团”用地分配和移民分布图，1份移民现状一览表，主要记载了日本“开拓团”夺占东北农民土地、欺压东北农民以及日本移民规模等方面内容，反映了日本对中国东北移民侵略的实质。
日本向中国东北移民是有计划、有组织的国家行为。“九一八”事变后，日本进一步研究制定向中国东北移民的侵略政策，实施“百万户移民计划”，企图通过移民达到永久统治中国东北的目的。通化宪兵队昭和十八年（1943年）3月3日《思想对策月报（二月）》中这样写道：“满洲拓殖公社根据第二次开拓五年计划，进行了第十三次集团开拓，康德十年（1943年）从日本佐贺县迁移二百户开拓团进入辉南县。”《第5次“移民团”用地略图，朝阳屯“移民团”部落配置图》详细画出了日本移民侵入上述区域的移民分布图。《集团移民现状一览表》等资料，则详细记录了东北“开拓团”分布的人数和户数。
档案证实“开拓团”名为“开拓”实为侵略。关东宪兵队司令部《关于收买土地引起中国人地主反对情况的通牒》档案，记录了公主岭山路乡集合“开拓团”实施收购约三千町土地的方案措施。
7.涉及美英战俘档案提供虐待盟军战俘证据。日军建立了“奉天俘虏收容所”，专门用来关押日军从太平洋战场俘虏的美英等盟军战俘。在关押期间，这些俘虏被安排在“满洲工作机械株式会社”等企业做工，遭受非人的虐待，境遇悲惨。日本战败时，奉天俘虏收容所把有关美英战俘的档案作为机密文件在第一时间销毁。此次发现的有关美英战俘的档案共有3件，主要包括1944年日军击落美军B29轰炸机部分战俘名单、审讯记录及奉天俘虏收容所对美英战俘管理的情况，价值珍贵，对于研究二战期间日军虐待美英战俘情况具有重要的史料价值。