批评者认为，印尼政府没有出台持续性抗疫政策，以及未能有效运用足够的检测和追踪等手段，造成德尔塔毒株出现灾难性传播。澳大利亚格里菲斯大学流行病学家布迪曼表示，德尔塔毒株感染性很强，危险性也大得多。如果政府未能迅速发现感染该毒株的病例，可能会导致更高的死亡人数。

印尼流行病学家协会专家玛斯达利娜认为，除提升检测数量外，印尼政府还应注重加强确诊病例和密接人群追踪工作。片面依靠紧急公共活动限制政策减少人员流动，不是应对疫情的正确方式。

自去年12月首次推出疫苗接种以来，印尼便将其视为应对疫情的一种重要方式。然而，疫苗接种覆盖率低，疫苗短缺导致人们未能按计划进行第二剂接种等问题层出不穷。截至8月4日，印尼仅有2196.5万人完成两剂疫苗接种，距离实现2.08亿人口接种目标仍有巨大差距。印尼卫生部长谷纳迪强调，今年初缺乏疫苗是阻碍该国疫苗接种工作的主要问题，预计未来数月这一情况将有所缓解。