针对被指是泄密源头，蔡正元2日发表“给林全的公开信”称，全世界无能的政府首长，面对危机事件只会“转移焦点、掩盖危机”，林全2日的开会表现正好如此，“认为国家刚闪过一场战争灾难，行政院却开了一场只有鸡毛蒜皮结论的冗长会议”。蔡正元解释说，PTT当天一早就在讨论，他同时公布了从PTT下载的对话截图，显示疑似现役军人1日上午8时34分在群组表示，“港内打雄三”“刚看它飞傻眼”。蔡正元说，导弹误射现场周围，起码有几百个军方人员与民众看到，都知道是怎么回事，林全却跟质疑泄密的民进党“立委”一样惊慌失措。3日，蔡正元又在脸谱列举多起误击事件“都是台湾挑起的”。他举例称，1979年大陆发表《告台湾同胞书》宣布停火，两岸从此进入实质停战阶段；1984年6月27日小金门岛“国军”炮击解放军角屿岛，双方相互炮战1小时，“国军承认误击”；1994年11月14日，金门发炮“误击”厦门，造成1人死亡、多人受伤，大陆碍于“九二共识”，没有发炮反击。

“是要查谁告诉蔡正元飞弹误射吗？”国民党“立委”林为洲称，整个高雄左营军区周边居民不是军人就是军眷，对武器都有一定了解，“雄风3”导弹被误射时，信息早就瞬间传开，老家在附近的国民党“立委”黄昭顺，即使人在“立法院”霸占发言台，也是第一时间掌握。林为洲说，现在重要的是厘清真相，当心侦查过程发生不必要的泄密事件，“行政院不要把查泄密当成遮羞布”。

《旺报》3日称，“行政院”不好好检讨误射及如何解决两岸沟通无门的问题，以避免突发事件扩大升级为区域冲突，却把重点放在有人泄密，试图转移焦点，何以让民众重拾对“国军”的信心。联合新闻网称，林全的指示实在令人怀疑，“到底执政团队的重点，是在查泄密抑或‘查正元’？”文章说，导弹发射升空时会发出非常巨大的声响与火光，整个左营港内数千名官兵必然听到或目睹，从网络上的照片可知，即使住在军区外的民众，也来得及在屋顶上拍下导弹的尾烟，“具备武器知识的人，不难分辨出它是雄3飞弹；也会知道绝不该在军港内发射，因此必定是意外”。换言之，当初网友在PTT发布、被蔡正元转述的消息，其实只有“闯祸者是金江舰”是营外民众无法得知的，“如此形迹明显又后果严重的意外，如果还认为可以掩饰得住，才是昧于事实。或者说，如果没有经过蔡正元的传播，而被媒体直接由PTT或爆料公社等处发现，行政院还会不会大张旗鼓查泄密？”《中国时报》还说，新当局上任一个多月，“内阁”风波不断，“日前虐狗事件已重创国军士气，未料再来一桩误射事件，军方岂有威信可言？”