杨玉龙表示，他在雅法和海法都看到了各种宗教信仰的人们和谐共处的情景，未来他将会对宗教对话这一课题进行思考和研究。谈到近期发生在耶路撒冷老城圣殿山（“尊贵禁地”）附近的巴以冲突，杨玉龙表示他并不赞同亨廷顿在《文明的冲突》一书中阐述的观点，他认为宗教问题的背后实际上是社会冲突问题，“塞缪尔·亨廷顿在（20世纪）90年代曾经提出文明冲突论，曾经盛极一时，但我个人认为文明冲突论更多地强调政治层面，但在社会层面（站不住脚）。我接触到很多犹太人、阿拉伯人，大家都是普通的老百姓，彼此之间的宗教差异并不成为冲突的原因。（近期巴以冲突）这个问题其实也不是宗教问题，而是个社会冲突问题，社会冲突问题需要政府去想各种合理的措施和手段去解决。社会冲突问题的本质依然是社会问题，而不是宗教问题，这也就很好地解释了为什么是这里而不是那里，全世界伊斯兰教、基督教，各种宗教并存共处的地方太多了，为什么会在这里发生（冲突）？它肯定是由特殊的社会原因造成的，彼此之间族群的关系、彼此之间政策的差异，包括民族情感的一些影响。因为巴勒斯坦和以色列之间的这种关系不是宗教原因导致的，其实是一种政治、社会、历史问题导致的。我们学者有必要通过学术研究找到他们冲突的主要原因。”