感染人乳头瘤病毒后，多数人没有明显症状。部分人可能出现寻常疣、扁平疣、跖疣等皮肤及黏膜部位的组织增生，有时伴有局部刺激症状，如瘙痒。

高危型HPV感染通常更为隐匿，常无明显症状，但可能引起上皮内病变。若感染持续存在，可能会逐渐进展，引发宫颈癌、外阴癌等肿瘤。这些肿瘤的组织会表现为乳头样、菜花样或鸡冠样的异常增生突起，并可出现异常出血和排液等症状。