之后公司就趁着这股热劲，先后为朱晓琳打造了《花仙子》、《风吻青山》等专辑，受到了不少粉丝们的支持和喜爱。接着还为她推出了《那一年我十七岁》、《梦江南》、《月儿弯弯照九州》等等歌曲，都被列入了传唱的经典曲目。风头一度盖过当时同期的那英和田震。

只是令人想不到的是，正当朱晓琳的歌坛事业发展得如火如荼的时候却突然的消失在人们的视线之中，几乎达到了销声匿迹。据悉，是因为当时的朱晓琳名气真的太大了，每个月要跑的通告高达近百场。而当时的她也才年仅十几岁的样子，正迎着高考，唱歌实在是占据了她太多的时间而导致考试发挥失常最后落榜了自己所向往的复旦大学。再加上公司方面的种种打压，且过于功利化。于是朱晓琳最后在学习与唱歌之间坚定的选择了前者，退出了歌坛。之后她也通过自己的努力进入了复旦英语进修班进行学习。

在学习外语的同时，朱晓琳当时还对服装设计产生了浓厚的兴趣。于是她便决定跟随下海经商的潮流，毅然的创立起了一家属于自己的服装公司。只是对于那个时候的朱晓琳来说，阅历还太少、根本没有太多的经验，所以结果也是以惨败收场。直到1994年，北京音乐台聘朱晓琳为客座DJ，主持一档休闲娱乐节目。1995年前后，太平洋影音公司重新组合，音乐人陈小奇新任总经理。他签约十几名歌手，想重振太平洋。朱晓琳是其中之一，光头李进、廖百威也在其中。但后来因为公司运转不得力，朱晓琳再次淡出歌坛。自在1999年朱晓琳推出了她阔别歌坛多年后的第一张新专辑《思绪》以外，之后便再无作品了。除了偶尔参加一些献唱以外，几乎很少再露面。