为了追查林子健在西贡的行踪，警方还派出大批警员到西贡市区进行了大范围的排查，发现有多间商户的监控摄像头均摄得林子健的踪影，并有商户表示见过林子健孤身本人，并无遭绑架的情形。

15日凌晨，根据调查情况和“天眼”提供的相关证据，警方以涉嫌“误导警务人员”逮捕了林子健。署理警务处处长刘业成，连日来的调查显示报案人的陈述与调查结果并不相符，于是以“误导警务人员”为名拘捕了报案人，并落案起诉。立法会议员、民建联葛珮帆表示，警方需要彻查事件，整件事匪夷所思，太不合情理，疑点重重，“民主党”盲撑，要对公众有个交代。而其他多名民主派人士，在林子健声称被人迷晕掳走后，将此事与广深港高铁“一地两检”方案扯上关系，不排除是为了反对“一地两检”而出现此事。

林子健因“误导警务人员”被捕后，“民主党”召开会议并会见了传媒，仍然拒绝为“事件”道歉。香港多名政治人士及报纸文章均表示，“民主党”诚信堪忧。而香港多个社团到“民主党”总部等地举行示威，批评“民主党”导致社会人心惶惶，促请该党尽快交代实情，并批评林子健虚报案件浪费警力，促请警方严执法。一些人还组织成立“林子健事件关注组”，要求“民主党”及其立法会议员就包庇林子健报假案欺警交代事件经过，向受其愚弄的市民公开道歉。

在此案调查过程中，行政长官林郑月娥曾表示，社会会看事实、证据及说法是否可信，自己会有判断；相信警方会全面调查，尽快找出真相，并呼吁市民不应就一件声称可能涉及刑事行为的事件，作无谓揣测及推敲。