很多人以为，两岸方面授权民间团体签署的第一份书面协议是1993年《汪辜会谈共同协议》。其实不然，真正的“破冰”是1990年两岸红十字会受权签署的《金门协议》。只是由于内容敏感，在相当长的时间里，彼此都秘而不宣，也就是我们常说的“只做不说”。
妥善解决遣返问题
事情的起源是上世纪80点代末90年代初发生的多起偷渡客遣返悲剧。当时大陆地区经济发展水平低于台湾地区，一些大陆民众在蛇头引诱下，铤而走险偷渡到对岸。对于被拘捕的大陆民众，台湾方面采取极不人道的遣返方式：把他们装进船舱，盖上船板，让船驶回大陆。由于舱内通气不畅，导致此行充满危险。1990年7月22日，台军放回的“闽平渔5540”号渔船在福建沿岸搁浅，里面有25具尸体和1名奄奄一息的幸存者。
悲剧的发生让海峡两岸都意识到，双方应该尽快进行接触，商讨如何妥善解决偷渡客遣返的问题。在两岸政治关系没有明确之前，双方务实地授权民间组织红十字会在金门进行谈判。
当时，金门还属于战时地区，由台湾方面“警备总司令部”管理。台湾红十字会总会秘书长陈长文与军方关系密切，深受军人出身、时任台湾当局行政机构负责人郝柏村的信任。台湾军方同意全力协助两岸红十字会开展务实合作，当局参谋本部进行规划作业，当时被列为“极机密”。
规划中定下几条原则：比如，两岸红十字会会谈过程中，完全不使用任何书面授权函件，不得留下会议记录，联系只能使用口头形式。为了便于掌控局面，台湾军方派出了作战次长室执行官邓定秩中将为“监军”，以红十字会顾问的名义，直接参与会谈。
而担任大陆方面主谈代表的是中国红十字总会秘书长韩长林。在会谈前夕，他住在福州西湖宾馆，因为要与台湾红十字会副秘书长常松茂密切联系，一天要与台北打很多个长途电话。饭店总机小姐发觉他与台湾“有异常联系”，还向有关方面汇报，得到的答复是：“不要多管闲事，接线就行了。”
台军人假扮服务员
1990年9月11日清晨6时，一艘悬挂着白色红十字旗，没有任何船只编号的渔船，在台湾军人扮演的渔民掌舵下，从金门金湖渔港出海，在沿岸台湾军警高度警戒下，驶向所谓“海峡中线”附近浯屿岛海面。船上坐的是台湾红十字会副秘书长常松茂。另一边，上午7时半，大陆方面人员乘坐的“厦渔507号”渔轮从厦门东渡码头上船，驶向浯屿岛海面。
东经118度08分04秒、北纬24度21分03秒，是双方约定的海上会船地点。在互相确认身份后，常松茂乘坐的渔船，带领大陆渔船进入了金湖渔港。
台湾红十字会总会秘书长陈长文、“国际组”主任徐祖安等台方官员，在岸上迎候大陆方面代表。作为谈判人员，乐美真成为首位踏上金门土地的国台办官员，只不过他是以红十字会理事的身份参加谈判。
台湾方面安排大陆人士入住金门的“仁爱新庄”。一同来到金门的大陆红十字会台湾事务部副部长的张希林很快发现，“仁爱新庄”中的服务员全是台军方士兵客串的，因为他们进入房门前，都会先敲门，并喊一声“报告”，完全是军队的模式。
务实处理敏感问题
5个共产党人（韩长林、乐美真、张希林、福建省红十字会副会长计克良和福州市委副书记方庆云）与4个国民党人（陈长文、常松茂、徐祖安、邓定秩）开始了谈判。对于敏感问题，双方都进行了务实处理。
比如遣返的对象。原来称是“非法入境的居民”，经过仔细推敲，改为“违反有关规定，进入对方地区的居民”。
比如协议落款的名称。使用双方都能够接受的两岸红十字组织名称。
比如协议的签字人，用两岸红十字组织代表韩长林、陈长文的名字，不体现职务的全称，也没盖公章。
比如协议落款的时间。最后采取既不写“公元”，也不写“民国”的方式，使用“1990年9月中旬”提法。
在协议中，确定了彼此遣返交接地点：双方商定为马尾—马祖（马祖—马尾），但依被遣返人员的原居地分布情况及气候、海象等因素，双方得协议另择厦门—金门（金门—厦门）。
协议规范了遣返程序：（一）一方应将被遣返人员的有关资料通知对方，对方应于二十日内核查答复，并按商定时间、地点遣返交接。如核查对象有疑问者，亦应通知对方以便复查。（二）遣返交接双方均用红十字专用船，并用民用船只在约定地点引导。遣返船、引导船均悬挂白底红十字旗（不挂其它旗帜，不使用其他的标志）。（三）遣返交接时，应由双方事先约定的代表二方签署交接见证书。
9月12日上午，双方达成协议。9月19日10时，陈长文在台北召开发布会，对外公布了两岸商谈达成的协议。新华社也在同一时间发布了《海峡两岸红十字会组织在金门商谈达成有关海上遣返协议》。
这是1949年后两岸民间团体受权签订的第一个书面协议，是两岸民间团体以事务性商谈的方式解决法律事务问题的有益尝试，堪称两岸协商的“破冰”。同年10月8日，第一批55名偷渡人员从马祖顺利遣返至马尾。从某种意义上说，早在1990年，两岸间实现了直航。
尾声：新竹收容所走入历史
这里不得不提“靖庐”，也就是新竹收容所。它原是1917年为纪念日本皇族北白川宫能久亲王而建。1957年在此设立“新竹警备分区指挥部”，之后由台湾入出境管理部门接收，成立了“大陆地区人民处理中心”。大陆偷渡客根据《金门协议》被遣返前，最后一站就是这“靖庐”。
时光荏苒。随着两岸经济社会发生剧变，大陆偷渡客日渐减少，于是收容所主要收容外籍偷渡者。这几年，就连外籍偷渡者也减少了。
今年10月25日，成立于1992年的新竹收容所熄灯吹号，关门歇业，走入历史。它从侧面也反映了这20多年来，两岸实力的此长彼消。