据朝日新闻报道，根据日本审计委员会的一项研究显示，发现过去日本防卫省所采购的单架国产F-35A战机费用比由美国生产的同一规格要贵3700万美元，而究其原因，则是由于日本政府坚持国内制造商参与生产所导致的结果。

该委员会还根据美国政府的外国军事销售（FMS）计划研究了日本对军事设备的采购（该计划允许日本国防部直接从美国购买军事装备）。

研究表明，通过FMS购买包括F-35A、“鱼鹰”运输机、“宙斯盾”导弹防御系统和E-2D预警机在内的军事设备的成本在2017财年达到35.8亿美元。相比之下，2013财年为10.3亿美元。

在这项研究中，审计委员会比较了在日本和美国购买的F-35A的价格。当日本在2012财年采购F-35A时，根据当时的汇率，单架价格约为8600万美元，比同时期美军的采购价格多出900万美元。到了2013年，当日本制造商三菱重工、IHI集团和三菱电机参与生产时，两国间的价格差距飙升至约4200万美元。而这个庞大的差距还在微幅上升。

审计委员会称，美方将这一差距归因于飞机的规格、研发成本的分担以及日本公司的参与（包括飞机的组装和检查）。

美方解释称，日本公司参与生产提高了价格，因为与美国公司相比，日本公司在制造战斗机方面的经验有限，因此这导致了陡峭而昂贵的学习曲线。

日本防卫省称，美日联合生产F-35A是为了帮助日本制造商开发制造和操作战斗机所需的技术。日本内阁在2012年批准了联合生产计划，并采购了42架F-35A。

日本防卫省表示，在发展战斗机技术的目标下，增加用于购买价格上涨的支出是合理的。目前，日本政府花费了13.5亿美元建造F-35A所需的设施。

在2018年8月，防卫省计划继续采购6架国内生产F-35A，总价值8.5亿美元，单架飞机约为1.41亿美元。但在2019年，日本政府终止了联合生产项目，转而采购引进的F-35A成品整机。这一转变意味着这6架飞机的购买总价变为6.2亿美元，比之前采购本土组装生产的F-35A单架节省3700万美元。

至于F-35A采购政策的改变，防卫省称需要以更低的价格购买飞机，因此政府去年决定再购买105架F-35A。审计委员还会呼吁商务部考虑与美国展开谈判，以获得合同管理费的豁免，该费用占FMS交易总采购成本的1.2%。在此之前，韩国和其他盟国与美国进行谈判后免于支付此类款项。