1997年，中共十五大召开。在十五届一中全会上，胡锦涛继续当选为中共中央政治局常委、中央书记处书记。在翌年举行的九届全国人大一次会议上，他当选为中华人民共和国副主席。

1998年，中央决定，军队、武警部队、政法机关一律不再从事经商活动。《胡锦涛文选》透露，当时胡锦涛兼任军队武警部队政法机关不再从事经商活动工作领导小组组长。

1998年7月28日，他在贯彻这项决定电视电话会议上说：“中央对这项工作总的要求，概括起来说是四句话：对军队、武警部队、政法机关及所属单位办的经营性公司要认真进行全面清理；这些公司同军队、武警部队、政法机关要尽快彻底脱钩；今后军队、武警部队、政法机关一律不再从事经商活动；国家财政对军队、武警部队、政法机关履行职能要给予必要的经费保证，也就是说从1999年起军队、武警部队、政法机关要全部‘吃皇粮’。”

胡锦涛表示：“我们必须从邓小平同志所说的事关党和国家会不会改变面貌的高度，从江泽民同志所说的防止亡党亡国危险的高度，深刻认识这个问题。这件事儿决不是可抓可不抓，而是到了非抓不可的地步；也不是可以缓抓慢抓，而是到了必须紧抓狠抓的时候。”

1999年5月8日，以美国为首的北约用导弹袭击中国驻南联盟大使馆，三名中国记者遇难，多人受伤，馆舍严重毁坏。5月9日，胡锦涛就此发表了电视讲话。他表示，北京、上海、广州、成都、沈阳等一些城市学生和群众还在美国驻华外交机构附近举行了示威游行。这一切，充分反映了中国人民对以美国为首的北约袭击我国驻南使馆暴行的极大愤慨和强烈的爱国热情。中国政府坚决支持、依法保护一切符合法律规定的抗议活动。我们相信，广大人民群众一定会从国家根本利益出发，自觉维护大局，使这些活动依法有序进行。要防止出现过激行为。警惕有人借机扰乱正常社会秩序，坚决确保社会稳定。

1993年到2002年12月，胡锦涛兼任中央党校校长。2000年6月7日，他在全国党校工作会议上说，中央党校和省级党校要把强化中青年后备干部培训作为重点，下大气力提高培训质量。鉴于县（市）一级在我们党的组织结构和国家政权中处于直接面向城乡基层的特殊重要地位，这一级主要领导干部承担着重要责任，中央决定，从现在起将全国县（市）委书记纳入中央党校培训轮训范围，以保证他们能够受到更高质量的教育。这是对中央党校和省级党校培训轮训任务的一个重大调整，也是适应新情况对干部培养工作的一个重要加强。

2002年11月，中共十六大召开。在十六届一中全会上，胡锦涛当选为中共中央总书记。

（本文未标明出处之引文，均引自《胡锦涛文选》第一卷）