俗话说，“打狗还得看主人”，日方此举摆明不给蔡英文面子。台湾“中华战略学会”研究员张竞分析说，事发当天，“新海研1号”所在海域的海象良好，目视辨识舰船距离至少可达5至10海里，而且“新海研1号”在海上作业阶段，都是全程开启船位通报系统，假如日方舰艇只是单纯查证目标，根本不必靠到如此近的距离。也就是说，日本海上保安厅是刻意闯进台方近岸海域，目的是制造海上执法记录，以便通过实质执法事实，主张该海域管辖权，其背后居心相当险恶。

民进党当局如此被日本打脸，也是咎由自取。马英九时期强力护渔、主张钓鱼岛权益，日本还和国民党当局谈判渔权等，但到了蔡英文上台，日本可谓予取予求。日本要求民进党当局开放核食品，即使岛内民众强烈反对，民进党还是强行开放；日本要在太平洋排放核废水，民进党不仅连声都不吭，而且驻日代表谢长廷还替日本找“依据”……

此次“新海研1号”遭日方骚扰，有岛内媒体猜测，最近日方加派舰艇不断在台湾东部海域巡逻，而台方因所谓“台日亲善”加上日方有“协防”之意，就任由日舰靠近花莲、苏澳外海，造成如今后患无穷。

可以说，日方的举动不仅打脸蔡英文，也捅破“台日亲善”的假象。就在几天前，台当局才派出前“立法院长”苏嘉全、王金平以及驻日代表谢长廷参加日本前首相安倍晋三的国葬，高雄还有人打造了安倍纪念铜像，“监察院长”陈菊为铜像揭幕。隔天，数百民众就前往台北“日本台湾交流协会”抗议。对比之下，更凸显民进党当局媚日不得人心。