与搭档之间的互动更是本作的最大亮点，这回特别请来原作动画声优（负责皮卡丘的大谷育江和负责伊布的悠木碧）协助配音，游戏中可以对搭档的皮卡丘／伊布抚摸、喂食树果，牠们也会有各种可爱的表情响应玩家。此外原作中需要占用其他宝可梦招式字段的野外行动相关招式，现已整并于搭档的“秘术”中，上天、下海、解决障碍物都方便许多。