中医认为，黄芩清肝胆，保肝，与抗氧自由基损伤有关。

黄芩对中枢抑制，能够起到镇静的作用。

对血液系统影响

黄芩对血液系统作用复杂，黄芩素等能够抑制血小板聚集;能抗凝血，能抑制凝血酶诱导的纤维蛋白产生。

抗变态反应

在抗变态反应方面，黄芩甙元较甙作用强。黄芩此种抗变态反应，不产生过敏反应，此外它对平滑肌本身，也有直接的松弛作用。黄芩甙元及黄芩甙均能抑制过敏性之浮肿及炎症，二者能耳毛细血管的通透性。

降低血压

黄芩酊剂、浸剂、煎剂、醇或水提取物、黄芩甙均可引起降压作用。浸剂口服能降低正常及慢性肾性高血压，酊剂可使神经性高血压回至正常。

利尿作用

在急性利尿实验中，黄芩甙元作用强，汉黄芩素次之。黄芩醇提取物及煎剂亦有利尿作用。

对血糖血脂的影响

黄芩能够降低血脂，能使血糖轻度上升。

解痉作用

黄芩可消除强直性痉挛的症状。

安胎作用

黄芩有清热安胎作用，可用于胎动不安，常与白术、竹茹等配合应用。