电视剧《暗河传》的结局充满了反转与遗憾，但也蕴含着一丝希望。

苏昌河自刎，暗河解散：老大家长被唐门毒杀后，苏昌河踩着慕词陵的尸体、挑断苏烬灰的手筋拿到眠龙剑，成为暗河新大家长。为填补暗河的债务窟窿，他搞起“彼岸”项目，甚至签了药人协议。最终，苏暮雨与苏昌河在旧码头决战，苏昌河主动撞向苏暮雨的剑自刎，眠龙剑也随之折断。苏暮雨解散了暗河，将兵器熔成铁花。

杀手转行，暗河变药铺：苏暮雨拿光暗河最后一点余钱给死者发了抚恤，白鹤淮把从药人实验室救回的孩子聚在草棚里，教他们认草药，曾经的杀手们纷纷转行，暗河的旧址变成了药铺“百草堂”。白鹤淮靠药王谷“逆魂九针”假死脱身，十二年后与苏暮雨重逢，两人一起隐居，开医馆治病救人。

全员遗憾，各有归处：慕雪薇和慕青阳这对欢喜冤家，死在金吾卫刀下，到死都没等到暗河“见光”的那天。谢七刀成为谢家最后一任老辈家主，平定萧永叛乱后，把刀埋在了师妹坟前。慕子蛰自焚时烧尽了所有傀儡线，谢不谢带着败给苏暮雨的遗憾离开了暗河。而慕雨墨和唐怜月在暗河解散后，终于得以相聚，唐怜月把机关房改成菜园，种着慕雨墨爱吃的芥蓝。