马宁的判罚确实多次引发争议，最近的一次是在2025年10月12日的世预赛印尼对阵伊拉克的比赛中。

2025年世预赛印尼对阵伊拉克：比赛补时阶段，伊拉克球员塔赫辛在禁区内肘击印尼后卫迪克斯，马宁出示红牌将其罚下，但以“迪克斯先犯规”为由拒绝判罚点球，这一判罚引发印尼队强烈抗议，技术总监因抗议被追加红牌。第67分钟，塔赫辛作为最后一名防守球员飞铲印尼前锋罗梅尼，马宁仅出示黄牌，他解释“球已出界，不满足红牌四要素”。整场比赛，印尼被判定18次犯规，领到6张黄牌+1张红牌（赛后追加），而伊拉克被判6次犯规、1张红牌（两黄变一红）。终场哨响后，马宁在1分钟内连续罚下3名印尼人员（1球员+1官员+1教练），引发现场球迷投掷杂物，马宁需安保护送离场。

2025年9月中超联赛：浙江队李提香因对判罚不满与马宁“贴脸理论”，马宁直接连出两张黄牌将其罚下，被批“滥用权威”。

2024年亚洲杯决赛：马宁单场判给卡塔尔3个点球，首个点球被前约旦官员斥为“廉价且犯罪”。

2024年5月中超联赛：马宁作为VAR裁判为浙江队判给的点球，事后被足协确认是“VAR介入”。同期青岛西海岸对阵海港的比赛中，蒋光太先触球的铲球动作被他判罚犯规+黄牌，面对“英超不算犯规”的抗议，马宁回怼“这是中超”。

2024年1月巴勒斯坦对阵卡塔尔：马宁全场3张黄牌全给巴勒斯坦，制胜点球判罚还被质疑“卡塔尔球员假摔”。