《朱雀堂》讲述了民国时期上海滩的一系列离奇案件，揭开了背后隐藏的权色交易与黑帮阴谋。

1929年，上海滩闸北弄堂慧安里惊现三具尸体，女尸孔倩儿身着戏服被摆成“接引亡魂”的祭女姿态，头顶打入“散魂钉”，壁橱内两具尸体一正一反，机关触发后火油倾泻焚尸。新人探长唐震云接手此案，遇到前来送断手的留洋法医夏漠，夏漠凭借专业知识揭穿了前来认领尸体的朱雀堂女老板高英偷梁换柱的诡计。

此后，凶手连杀数名舞女，这些案件都与朱雀堂有着千丝万缕的联系。夏漠和唐震云起初以为凶手是戏痴温玉亭，他因迷恋舞女红袖不成，认定孔倩儿破坏了他和红袖的感情，于是残忍作案。但随着调查深入，他们发现这背后纠缠着更险恶的权色交易，那些被杀的女孩都是即将献祭给幕后权贵的玩物。

高英为了保护手下姑娘，与夏漠、唐震云先敌后友，结成联盟共同查案。他们发现高英的父亲程振东似乎与案件有关，而程振东其实是被日本特务影佐祯昭操控的傀儡。舞女红袖的亲弟弟程立仁，为给姐姐报仇，在程家当了20年养子，最终手刃仇人程振东，却被影佐祯昭一枪打死。

高英发现亲爹是幕后黑手后，将蛊虫母体植入程振东的续命装置中，程振东最终被自己养的虫子咬死。高英随后炸毁程家地下军火库，与仇人同归于尽。唐震云查到了权贵犯罪的证据，却在警局里“被自杀”。夏英奇在高英死后接手朱雀堂，将其改成帮助女性的“青鸾社”，而影佐祯昭仍在继续谋划阴谋，黑暗仍在蔓延。