学校建有12个国家级人才培养模式创新实验区和12个国家级工程实践教育中心，每年立项各级大学生科研训练计划项目1500余项，组织参加各级各类学科竞赛90余项。

拥有两院院士12人，长江学者（含长江学者青年学者）55人，海外高层次人才引进计划入选者49人，国家高层次人才引进计划入选者16人，国家杰出青年科学基金获得者43人。

在教育部第三轮全国学科评估中，东南大学12个学科进入全国前七，10个学科位列全国前五，3个学科位居全国第一。10个学科进入ESI全球前1%。