在启动赤潮灾害二级应急响应后，福建省海洋与渔业厅同时要求漳州、泉州两地立即关闭赤潮发生海域的养殖生产区，并加强养殖渔船的管控，暂停水产品采捕作业，严禁赤潮周边海域水产品上市。同时海洋与渔业部门也加强所辖海域，特别是养殖生产区的监视监测。
福建省水产技术推广总站站长黄健：作为监测部门，加密监测，对赤潮发生区域不间断地，每天一监一测，一种是测赤潮生物的情况，另外，因为有贝毒这个东西，也测赤潮区域的生物体毒素的含量。
据福建省海洋与渔业厅最新的监测报告显示，截至6月12日，福建省受有毒赤潮生物影响的主要为泉州惠安部分海域，影响范围约3平方公里，漳州附近海域12日当天未检测出链状裸甲藻，初步判断赤潮已经消亡。
被关闭养殖区的何时重新开放，将根据进一步监测结果判定。
福建省水产技术推广总站站长黄健：要连续监测两周以后，没有发现赤潮，包括赤潮生物消亡了，含有毒素的贝类生物体里面检不出毒素来，才能算结束。
目前，漳州、泉州两地的市场监督管理部门已经加强了青蛤等贝类产品的流通环节的排查，专家也提醒，不要因为赤潮而造成不必要的恐慌。
福建省水产技术推广总站站长黄健：赤潮发生的养殖区已经关闭了，产品不可能上市流通。但是作为市民，在吃贝类，比如最近的一些淡青蛤、牡蛎，在这个期间，大家要食用，还是要谨慎。
