馆内展出距今近千年的六朝时期瓷器和陶俑等珍贵文物，其中，镇馆之宝是“釉下彩羽人纹盘口壶”和“青瓷莲花尊”。整个展览围绕六朝都城的面貌、历史文化的成就为主线，总共展出文物约1200件，其中大部分来自于南京市博物馆的考古出土文物。
宋元明清
时间推移到宋元明清时期，接下来要说的五座博物馆都在这四个朝代时间点上。
江南贡院始建于南宋孝宗乾道四年后(公元1168年)，当时属县学、府学考场。明朝建立后定都金陵(南京)，改为乡试、会试的场所，规模随之扩大。明成祖迁都北京以后，专门用作乡试考场。鼎盛时期，用于考试的号房多达二万余间，可同时容纳二万多名考生参加考试，被称为中国古代最大科举考场。
中国科举博物馆便是在江南贡院的基础上扩建，已开放的部分场馆包括博物馆地下三层，地面上明远楼、至公堂、号舍、碑刻及南苑的魁光阁等，含11个展厅，是中国唯一一家地下式博物馆。
